人文社科
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教育部人文社会科学重点研究基地中国农村教育发展研究院
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教育部人文社会科学重点研究基地世界文明史研究中心
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教育部高校辅导员培训和研修基地（东北师大）
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教育部国别与区域研究中心东亚研究院
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国家民委“一带一路”国别和区域研究中心东亚研究院
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全国妇联妇女（性别）研究与培训基地女性研究中心
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教育部国际教育法治研究中心
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国家基础教育实验中心
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教师教育省部共建协同创新中心
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教育部高校思想政治工作创新发展中心
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国家语言文字推广基地
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国家民委中华民族共同体研究基地
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思想政治教育研究中心
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东亚研究院
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思想政治理论课教学方法改革研究中心
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中国基础外语教育研究中心
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中国365体育投注美育研究中心
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传统文化与当代中国哲学研究中心
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世界文学与比较文学研究中心
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城镇化与区域发展研究中心
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365体育投注艺术教育质量监测研究基地
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吉剧艺术与文化研究基地
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中国共产党思想政治教育文献研究中心
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心理健康教育研究中心
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东北抗联与伪满洲国资料研究中心
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英语语言史研究中心
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西方马克思主义现代性理论研究中心
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教师教育东北协同创新中心
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中国农村教育发展重大需求协同创新中心
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创新创业教育重大需求协同创新中心
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教育信息化重大需求协同创新中心
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文化创意产业协同创新中心（培育）
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长白山音乐舞蹈艺术协同创新中心（培育）
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东亚文明研究中心
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社会主义核心价值观教育研究中心（培育）
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中国体育公共外交研究中心（培育）
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党内法规建设研究基地
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吉林省法治理论研究基地
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“伪满”历史文化研究基地
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吉林省现代大学治理研究基地
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习近平文化思想研究中心
自然科学
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药物基因和蛋白筛选国家工程实验室
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吉林松嫩草地生态系统国家野外科学观测研究站
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国家环境保护湿地生态与植被恢复重点实验室
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动力电池国家地方联合工程实验室
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农业基因工程教育部工程研究中心
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植被生态科学教育部重点实验室
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多酸与网格材料化学教育部重点实验室
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应用统计教育部重点实验室
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数字化学习支撑技术教育部工程研究中心
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分子表观遗传学教育部重点实验室
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紫外光发射材料与技术教育部重点实验室
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长白山地理过程与生态安全教育部重点实验室
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松嫩草地生态系统教育部野外科学观测研究站
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糖复合物教育部工程研究中心
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东北水污染低碳治理与绿色发展教育部工程研究中心
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国家草品种区域试验站（长岭）
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吉林国家应用数学中心
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细胞和基因药物质量控制重点实验室
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吉林省生态恢复与生态系统管理重点实验室
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中国东北资源环境研究吉林省高等365体育投注重点实验室
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吉林省有机功能分子设计与合成重点实验室
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教育软件吉林省高等365体育投注重点实验室
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吉林省动物资源保护与利用重点实验室
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智能信息处理吉林省高等365体育投注重点实验室
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吉林省长白山天然药物化学与生物学重点实验室
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认知与脑科学吉林省高等365体育投注重点实验室
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吉林省先进能源开发及应用创新重点实验室
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吉林省高端科技创新平台“先进能源材料研究中心”
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纳米生物传感分析吉林省高等365体育投注重点实验室
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吉林省神经可塑性重点实验室
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吉林省可持续先进功能材料重点实验室
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吉林省长白山湿地生态过程与环境变化重点实验室
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固态电池吉林省协同创新中心
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吉林省大数据分析重点实验室
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吉林省草产品工程联合技术创新实验室
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吉林省认知神经科学与脑智发展重点实验室
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吉林省冰雪运动重点实验室
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吉林省锂离子电池材料科技创新中心
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吉林省湿地恢复与功能开发科技创新中心
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吉林省多酸及金属纳米材料科技创新中心
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吉林省经济植物生物技术科技创新中心
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吉林省城市污水处理与水质保障科技创新中心
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吉林省人类干细胞库科技创新中心
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吉林省“互联网+”教育科技创新中心-智慧教育分中心
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吉林省“互联网+”教育科技创新中心-知识媒体技术分中心
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吉林省航天特种涂层材料科技创新中心
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吉林省农业气象灾害风险评估与防控科技创新中心
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吉林省教育人工智能跨区域合作科技创新中心
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吉林省应用数学与交叉科学中心
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人类干细胞库国际（科技合作基地）联合研究中心
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东师生物分子制备与应用吉林省高等365体育投注工程创新训练中心
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数据驱动的应用统计方法研究国际科技合作基地
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吉林省湿地生态科技国际合作基地
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草地生态与管理利用国际联合研究中心
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脑智发育检测与评估校企联台技术创新实验室
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吉林省新型信息存储技术国际科技合作重点实验室
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吉林省植物工业工程实验室
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吉林省药物筛选工程实验室
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吉林省网络与智能教育工程实验室
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吉林省水污染控制与资源化工程实验室
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吉林省糖复合物工程实验室
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吉林省鸟类生态与保护遗传工程实验室
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吉林省脑认知与类脑智能工程实验室
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吉林省教育与人工智能融合创新工程研究中心
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吉林省中药生物工程重点研究室